Для того, чтобы обновить версию сервера в Minecraft, вам надо скачать плагин для настраиваемых серверов майн крафт, который вы сможете найти на сайтах в инете, их на самом деле множество. При помощи их вы сможете менять настройки игрухи. В папочке с плагином вы всегда найдете файлик, у которого расширение .jar и несколько других файлов. Вам надо копировать файл .jar и другие скаченные файлики в папку плагины в директории сервера игрушки. После запускаем сервер и ждем его прогрузки. После вызываем консоль и в ней вбиваем stop. Далее сделайте папочку в директории с плагином под именем update, качните плагин и скопируйте новый файл .jar в созданную папочку. После выполните перезапуск сервера.