В разных частях разное игровое время. Это может быть и третий крестовый поход, и великая французская революция. Но в целом, в глобальном масштабе весь временной отрезок - это эпоха Средневековья и Эпоха Великих открытий. В каждой из глав свои особенности прохождения, свои методы борьбы, методы атак и блокировок, методы фарма вещей и поиска необходимых сведений. В целом весь сюжет игры сосредоточен на жесткой борьбе двух тайных организаций - тамплиеров и ассасинов. Игроку дается возможность внести существенный вклад в победу одной из них.