Тут зависит от того с какого лаунчера вы его запускали и куда ставили. Чаще всего достаточно просто удалить файлы, которые были добавлены при установке мода, следовательно и сам мод удаляется. Если это не помогло - переустановите MineCraft, это вариант, который точно поможет. В многих лаунчерах так же делают выключатели модификаций, их можно найти как при запуске лаунчера нажав на шестеренке, так и в самих настройках главного меню игры. Если это клиент сервера, то там уже удалить ничего не удастся, так как идет авто-скачивание thaumcraft.