Если вы полностью очистили этаж или комнату то после истечения срока в 2 дня бункер будет закрыт, но это не значит что после этого срока если вы снова придете и начнете бункер заново проходить то в тех комнатах и складах уже будет пустой. Потому что разработчики сделали так что один раз обчистил бункер на второй раз там уже ничего не появляется кроме новых зомби и все. И тогда нужно переходить к новому бункеру и обчисчать по одному их. Восстановиление вещей в бункерах не предусмотрено, зато если вас в бункере убили пока он не закроется тело ваше будет там и можно на втором заходе забрать вещи.