Здравствуйте! Удалить отдельно не затрагивая игру не получится, в любом случае придётся переустановить её. Я себе тоже как-то ставил мод на графику, отдельным приложением он был в установке и удалении программ, после его удаления игра крашнулась и следом за модом пришлось удалять игру. Поэтому можете смело сразу удалять целиком всю игру, но вроде сохранения можно будет потом перекинуть, с ними всё будет в порядке.