Чтобы прокачивать оператора, вам нужно также зарабатывать на нём опыт используя его новые или старые способности на любой карте в игре Warframe.
В начале будет трудно получать очки, но после открытия первых новых способностей это будет очень легко. Вам нужно накапливать очки и тратить их на улучшения линз в вашем кресле в комнате где сидит оператор. Там же, если к нему подойти на варфрейме, можно открыть меню в котором будет указана прокачка оператора, тут же его и улучшать нужно будет.