Контейнеры в игре распространены повсеместно практически на всех картах при прохождении. Но такие контейнеры имеют свои механизмы защиты. Включается таймер на самоуничтожение и если вовремя его не подобрать, то такой контейнер попросту взорвется. Сколько времени останется до взрыва неизвестно до тех пор, пока контейнер не окажется в зоне действия Вашего радара. При поиске контейнера необходимо ориентироваться на слабый сигнал оранжевого цвета, причем в самом начале хода. Когда контейнер будет найдет, то его остается лишь подобрать. Также контейнеры могут быть уничтожены при взрыве. Выпадают контейнера и автоматом в случае уничтожения пришельцев в случайном порядке.
