Dota 2 сама удалиться не может. У меня была такая же проблема, когда мне пришлось переустанавливать игру. Такое часто бывает когда вы резко выходите из игры. Например у вас выключили электричество и компьютер выключился, завершение игры прошло не очень успешно и там могли возникнуть ошибки и при следующем запуске игры у вас будет показана что игра не установлена, но на самом деле она есть, просто путь к ней потерялся, вы можете все вернуть проверив файлы игры в настройках.