Здравствуйте! Тут всё зависит что за мод у вас установлен. Дело в том, что бывают моды которые устанавливаются как дополнение и их потом можно спокойно удалить через панель установки и удаления, а бывают такие, которые можно удалить только вместе с игрой. Чтобы понять можно ли удалить мод без удаления самой игры, зайдите в панель установки и удаления, если там этого мода нету, то остаётся только удалять игру целиком и переустанавливать.