Как раз для того что бы достать корабль вам необходимо будет первое так это назначить на него пилота, а вот потом выбираете кор и далее необходимо будет выбирать точку для разведки, после этого он должен будет отправится в разведку. После того как он вылетит на разведку и вернется обратно его можно будет использовать по назначению. Суть в том что такое случается и скорее всего это небольшой баг который разработчики так и не исправили.