Всего их пять в игре. Также существует бункеры, например убежище мэра Бостона около форта Хагена. Убежище 111 - отсюда начинается игра. Убежище 75 находится в подвале начальной школы Мальдена, там обитают наёмники.Убежище 114 спрятано в метро Парк-стрит и находится во власти гангстеров.Убежище 81 тут живут мирные, есть смотрительница, ее можно подкупить, дав ей яблоки или заболтав ее.
Убежище 95 - тут живут наёмники.