Все зависит от того какой именно мод вы решили себе установить, ведь проблема в том что каждый мод может устанавливаться по разному, ведь есть некоторые моды которые устанавливаются как раз автоматически с помощью приложения и таким образом вам не нужно специально файлы копировать в определенные папки или же отдельно выбирать и заменять данные файлы. А вот некоторые специально необходимо добавлять в системные файлы.