Поезд - это одна из игровых локаций, которую вам придётся ещё и самостоятельно собирать передвигая вагоны. Пока поезд движется придётся поубивать всех десантников высадившихся на его крышу. После окончания противников за вами прилетит самолёт и объяснят вашу новую миссию. Особой смысловой нагрузки поезд в дедспейсе не имеет - это просто локация с пострелялками и всё. Так что можете просто пробежать его до конца и не задумываться ни о чём.