Здравствуйте! Для этого надо вернуться на свою базу, или колонию и там будет опция ремонта корабля. Также отремонтировать корабль можно у ваших союзников, или нейтральных империй. Плюс можно купить ремонтные наборы, которые можно будет использовать в критические моменты. Ещё когда будете продвигаться к центру галактики, обязательно по пути создавайте сеть колоний, в них вы сможете заправиться и починить корабль.