Сам не пробовал, но думаю что особых изменений вы не заметите, просто некоторые квесты будут недоступны, но лучше всё же этого не делать, а то есть вероятность упустить некоторые плюшки. Я как-то раз ради прикола решил убить одного сюжетного перса, разумеется предварительно сохранившись, и посмотреть что будет, в итоге я его убил и игра мне ничего не сказала, потом бегал и тоже всё было норм, но в итоге от греха загрузил сохранение.