Сюжет игры в том, что на самом деле все приключения главного героя не являются настоящими. Игрок находиться в компьютерной симуляции , которая создана и основана на воспоминаниях главного героя.Кстати ,главного героя зовут Морган Ю и находиться он на станции Талос-1. И все время мы играли не за Моргана , а за другого персонажа , которому подсадили генетическую линию главного героя и этого персонажа зовут Мимик.В ходе игры Морган Ю ( Мимик) может не только общаться с людьми , но и сопереживать им.Кто знает, может этот шаг приведет к полноценному контакту и налаживанию отношений с Тифонами. Тифоны это же существа которые захватили Землю.