Руны используются для модификации предметов, которые имеют гнезда.
В городе есть мастер по рунам Эйдан, находится слева от таверны, где нанимаются герои в помощь.
Руны можно вставлять и вынимать, но разбивать/ломать нельзя.
Излишек рун можно продавать торговцу, выкидывать или использовать для улучшения других рун.
Вынимание и улучшение рун платно, но стоит не много.
При прохождении игры Эйдан все подробно рассказывает.